7 мая 1994 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II совершил освящение креста на Центральном проезде поселка Семхоз Сергиево-Посадского района в основание Патриаршего Подворья святого великомученика Георгия Победоносца.
Инициативу по строительству храма для жителей поселка Семхоз проявил настоятель храма Архистратига Михаила в Тропареве города Москвы протоиерей Георгий Студенов, проживший в Семхозе более двадцати лет. После сбора подписей земельный участок был выделен при поддержке главы администрации В. Н. Чурилина. Автором проекта, который включал большой храм и дом причта с малым храмом, стал главный архитектор Сергиева Посада В. Д. Журавлев.
Летом 1994 года началось строительство дома причта с малым храмом в честь святого великомученика Георгия Победоносца. В его основание протоиерей Георгий Студенов заложил камень и кусочек керамики от купели святого равноапостольного князя Владимира из древнего Херсонеса (Севастополь). Большая часть забот по строительству легла на плечи матушки Ольги Алексеевны Студеновой. 19 января 1996 года в храме состоялась первая Божественная литургия.
Краеведческие исследования показали, что в непосредственной близости от Подворья в XV–XVII веках располагалось село Николо-Поддубное с храмом святителя Николая, которые были разрушены в начале XVII века в период Польского нашествия. В память о древнем Никольском храме Святейший Патриарх Алексий II освятил антиминс для приставного престола в честь святителя Николая, архиепископа Мир Ликийских. Строительство большого храма было отложено на неопределенное время, поэтому к малому храму пристроили алтарную апсиду и колокольню.
С 1996 года в храме регулярно совершаются богослужения во все субботние, воскресные и праздничные дни. Действует воскресная школа со столярной мастерской и хоровым классом, проводятся катехизаторские беседы, спортивные и фольклорные мероприятия, организуются паломнические поездки.
Первым настоятелем Подворья стал строитель храма протоиерей Георгий Студенов. Богослужения совершали, в основном, клирики храма Архистратига Михаила в Тропареве города Москвы: протоиерей Георгий Сорокин, протоиерей Андрей Шумилов, священник Алексий Лю, священник Георгий Шаламберидзе, священник Илия Паршаков, протоиерей Александр Войтенко (с 2003 года), а также протоиерей Георгий Коновалов и другие.
В 2013 году настоятелем храма был назначен протоиерей Александр Войтенко. В 2014 году штатным клириком стал диакон Сергий Шпехт. К 25-летию Подворья был проведен капитальный ремонт здания, устроен балкон для певчих. Трудами прихожан храма – преподавателей и выпускников Иконописной школы при Московской духовной академии – был заменен временный иконостас.